Les microscopes numériques, à ne pas confondre avec les MEB ou Microscopes à Balayage Électronique, restent avant tout des microscopes optiques. En revanche, ils associent des « optiques classiques » avec une chaine de visualisation et de traitement numérique. C’est cette association qui permet d’allier une grande simplicité d’utilisation et une vaste panoplie d’outils d’analyse et de mesures.